В Консоли в этот момент появляется группа ошибок с bootstrap
Error: Unexpected null or undefined: this._blob

Экспериментальным путем нашел проблему - в файле Preferences была настройка
"disable_canvas_reading":true

Поменял на false и видео в Whatsapp перестало пропадать.

Или в Настройках не надо включать это
Отключить способ идентификации пользователя "canvas fingerprint"