Принципиальное отличие BitTorrent Sync от обычных «облачных» сервисов вроде популярного Dropbox заключается в том, что синхронизация файлов здесь осуществляется по хорошо знакомому протоколу BitTorrent, на основе которого работают пиринговые сети. При этом файлы копируются напрямую между подключёнными компьютерами, а не попадают на некие промежуточные серверы, где их можно перехватить или подменить. К тому же благодаря отсутствию «пит-стопов» в «облаке» передача файлов производится на максимальной скорости, доступной в вашей сети.

Суть BitTorrent Sync состоит именно в том, что ваши файлы не лежат где-то в «облаке» на неизвестно где установленном и неизвестно кому принадлежащем сервере, а хранятся только на ваших компьютерах. Протокол BitTorrent при этом применяется исключительно для синхронизации. Весь трафик шифруется 256-битным ключом AES, создаваемым на базе случайной строки, уникальной для каждой пересылаемой папки.